Video âm nhạc của "Fix You" do Sophie Muller đạo diễn, người trước đó đã từng đạo diễn cho video "In My Place" của nhóm hồi năm 2002.[46][47] Video đã được quay trong giai đoạn cuối của hai chuyến lưu diễn vào 4 và 5 tháng 7 năm 2005 tại Sân vận động Reebok ở Boston, Anh.[48] Số lượng khán giả đến theo dõi buổi hòa nhạc dường như đã tăng gấp đôi cho việc quay video, yêu cầu công việc phải thực hiện hai lần mỗi ngày mới kịp hoàn thành.[20][49]

Trong nửa đoạn video đầu tiên, giọng ca chính của ban nhạc, Chris Martin đi lang thang khắp các con phố ở London bắt đầu từ Phố Tooley dưới Trạm cầu London, trong khi khẩu hiệu "Made Trade Fair" được chiếu lên Rạp Hoàng quốc gia, sử dụng màu sắc ITA2 tương tự như bản cover của X&Y. Đường hầm nơi Martin được nhìn thấy đang đi lang thang đặt bối cảnh ở trong và cả xung quanh London St Pancras và nhà ga King's Cross, và quá trình quay phim cho video diễn ra trong thời gian tái phát triển và mở rộng của London St Pancras International. Tiếp đó Martin đi bộ qua Cầu Waterloo bắc qua Sông Thames và nối giữa đại học Southbank và khách sạn The Strand. Ngay khi tiếng đàn guitar điện cất lên, tư thế đi bộ của Martin chuyển sang chạy bộ như đang lao ra các con phố của London, đến khi di chuyển rất nhanh đến một góc của sân khấu trong Sân vận động Reebok ở Boston, nơi anh tham gia cùng thành phần còn lại của ban nhạc cho đoạn cuối của ca khúc. Khán giả hát theo đoạn điệp khúc của ca khúc cùng với ban nhạc, và cuối đoạn video Martin cảm ơn khán giả vì sự hỗ trợ của họ và cầu nguyện cho họ có một đêm tuyệt vời.

Video bắt đầu công chiếu vào 1 tháng 8 năm 2005.[50] Video âm nhạc đã nhận được đề cử tại lễ trao giải Hiệp hội Sản xuất video âm nhạc thường niên ở hạng mục Người lớn Đương đại. Sau khi nó phát hành, video âm nhạc đã được sử dụng thêm nhằm tưởng nhớ các nạn nhân trong Vụ đánh bom tại London ngày 7 tháng 7 năm 2005, mặc dù nó đã được quay trước khi vụ việc xảy ra.[20]